Struktur mit Profil – Sequenzalignments für die Homologiemodellierung

Struktur mit Profil – Sequenzalignments für die Homologiemodellierung

Die räumliche Anordnung eines Proteins ist entscheidend für dessen Funktion. Experimentelle Methoden, mit denen sich diese Anordnung bestimmen lässt, sind häufig sehr aufwändig und teuer. Yanxiang Zhou hat Abhilfe geschaffen und ein Programm entwickelt, das mit Hilfe bereits entschlüsselter Proteinstrukturen Modelle für noch unbekannte Strukturen erstellt. Dabei wird eine evolutionäre Verwandtschaft zwischen einer Proteinbaustein-Abfolge, deren Raumstruktur unbekannt ist, und einer solchen mit bekannter räumlicher Struktur hergestellt. In einer Datenbank hat der junge Forscher die Profile etlicher Proteinstrukturen zusammengefasst. Die Vorhersage der Raumstruktur hat große Bedeutung für die Entwicklung neuer Medikamente.